KRÁTKÉ KURZY

Neděle 20. září 2026

Kurz A - Praktická interpretace EI hmotnostních spekter (4x 1:45 hod; neděle 14:00-15:45, 16:15-18:00 a pondělí 8:30-10:15 a 10:45-12:30)

 přednášející: Mgr. Miroslav Polášek, Ph.D., Ústav fyzikální chemie J. Heyrovského AV ČR, v.v.i. Praha

    V úvodu kurzu budou probírány základní pojmy a principy týkající se elektronové ionizace a vzniku hmotnostních spekter, včetně krátkého přehledu základních mechanizmů fragmentačních reakcí a obecného postupu při interpretaci spekter. Hlavní náplní kurzu bude intenzivní cvičení na vybraných příkladech hmotnostních spekter elektronové ionizace různých typů organických sloučenin s maximálním důrazem na samostatnou práci účastníků pod vedením lektora. Kromě klasických přednášek probíhají i krátké kurzy určené zejména pro začátečníky. 

Kurz B - Když LC-MS nefunguje: praktický troubleshooting (2x 1:45 hod; neděle 14:00-15:45, 16:15-18:00)

 přednášející: prof. PharmDr. Lucie Nováková, Ph.D., Farmaceutická fakulta, Univerzita Karlova, Hradec Králové

    Kapalinová chromatografie s hmotnostní spektrometrií (LC-MS) představuje komplexní analytický systém. Získání spolehlivých dat je ovlivněno separačními podmínkami v LC, ionizací v iontovém zdroji, parametry hmotnostního analyzátoru, ale všechnu snahu může zmařit již nevhodně připravený vzorek. V důsledku této komplexity může velmi snadno dojít k chybě v jakékoliv části pracovního postupu, což má negativní vliv na získaná data či dokonce může sběr dat zcela znemožnit. Budou diskutovány charakteristické projevy problémů v systému LC-MS, jako problémy systémového tlaku, základní linie, tvaru píku, retenčních časů, odezvy systému, kontaminace a mnohé další. Tyto problémy budou dány do kontextu s možnými příčinami a budou diskutovány přístupy k jejich správné diagnostice a možnosti řešení. Samozřejmou součástí této diskuse je i téma správné laboratorní praxe a pravidelné údržby jako prevence vzniklých problémů. Cílem kurzu je rozšířit zkušenosti účastníků v oblasti troubleshootingu v LC-MS a podpořit tak jejich schopnost pro časově efektivní a spolehlivou identifikaci příčin analytických problémů na základě dat, nikoli pouze empirického přístupu „trial-and-error“. Proto bude součástí kurzu i řešení praktických příkladů.

Kurz C - Publishing scientific papers - Insights from an editorial perspective (2x 1:45 hod; neděle 14:00-15:45, 16:15-18:00)

 přednášející: prof. Dr. Juliane Hollender, Švýcarský federální ústav vodních věd a technologií (EAWAG) ETH Zürich - odkaz

     Podělím se o své zkušenosti seniorního vědeckého pracovníka v oboru a přidruženého editora časopisu Environmental Science and Technology s publikováním studií z oblasti environmentální chemie se zaměřením na hmotnostní spektrometrii. Budeme diskutovat o tom, jak studii připravit tak, aby byla atraktivní pro publikaci i citování, a také jak prezentovat data a metadata tak, aby byla dohledatelná, přístupná, interoperabilní a znovu využitelná (FAIR). Kurz bude probíhat v anglickém jazyce. 

Kurz D - Analýza dat v softwaru GraphPad - prakticky, názorně a jednoduše (2x 1:45 hod; neděle 14:00-15:45, 16:15-18:00)

 přednášející: prof. RNDr. David Friedecký, Ph.D., Fakultní nemocnice Olomouc

         Jednorozměrná analýza dat tvoří nezbytnou součást každého vědeckého experimentu. Správné, graficky přehledné vyhodnocení je klíčové pro prezentaci výsledků. V kurzu se naučíme používat základní statistické nástroje a jejich správnou interpretaci. Během kurzu vyzkoušíme jak komerční software Graphpad Prism, tak freeware Jasp a Jamovi. Pro výpočet síly studie použijeme G*Power. Na závěr srovnáme výstupy ze statistických programů s AI ChatGPT. Vlastní notebook s nainstalovanými software/freeware je výhodou. Vlastní data jsou vítána.

Pondělí 21. září 2026

Kurz E - Moderní přístupy k vícerozměrné analýze dat v hmotnostní spektrometrii (2x 1:45 hod; pondělí 8:30-10:15 a 10:45-12:30)

 přednášející: Ing. Eva Cífková, Ph.D., Přírodovědecká fakulta, Univerzita Hradec Králové 

       Kurz bude zaměřen na komplexní pohled na zpracování dat v hmotnostní spektrometrii, od využití QC vzorků pro korekci šumu až po finální biologickou interpretaci. Pozornost bude věnována především vícerozměrným statistickým technikám, které umožňují identifikaci klíčových rozdílů mezi studovanými skupinami. Cílem je proměnit komplexní experimentální data v jasně definované a vědecky podložené závěry. Teoretické poznatky budou přímo aplikovány při práci s reálnými daty z klinické studie.

Kurz F - Necílená analýza kontaminantů v životním prostředí v komentovaných příkladech (2x 1:45 hod; pondělí 8:30-10:15 a 10:45-12:30)

 přednášející: doc. Mgr. Roman Grabic, Ph.D., Fakulta rybářství a ochrany vod, Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích

       Kurz bude zaměřen na problémy, se kterými se setkáváme při identifikaci neznámých sloučenin ve složkách životního prostředí. Necílená analýza začíná přípravou vzorků a nastavením MS metod pro sběr dat. V kurzu budou demonstrovány základní postupy, které je možné použít, jejich výhody i nedostatky. Velká část přednášek pak bude věnována možnostem identifikace neznámých sloučenin, interpretace dat a komunikace výsledků. Vše na komentovaných reálných příkladech z praxe přednášejícího.

Přednášející

Miroslav Polášek se začal zbývat hmotnostní spektrometrií v roce 1991, kdy nastoupil jako odborný pracovník do oddělení chemické fyziky tehdejšího Ústavu fyzikální chemie a elektrochemie J. Heyrovského, Československé akademie věd. Zde až do roku 1998 pracoval po boku dr. Vladimíra Hanuše a pod jeho laskavým vedením postupně pronikal do tajů objasňování struktury organických sloučenin pomocí metod hmotnostní spektrometrie. Po následující dvouleté stáži ve skupině prof. F. Turečka na University of Washington v Seattlu se v roce 2000 vrátil na zpět na ÚFCH JH, kde působí dodnes. Ve své současné výzkumné práci mj. kombinuje experimentální a teoretický přístup ke studiu fundamentálních aspektů fyziky a chemie iontů v plynné fázi, zejména iontově-molekulových reakcí a fragmentací molekulových iontů.

Lucie Nováková je profesorkou na Katedře analytické chemie Univerzity Karlovy, Farmaceutické fakulty v Hradci Králové. Její výzkum je orientován na rychlé chromatografické techniky LC a SFC a jejich spojení s hmotnostní spektrometrií. Je zapojena do široké škály výzkumných projektů zaměřených na farmaceutickou analýzu, analýzu rostlin a bioanalytické metody. Důležitá část jejího výzkumu proto spočívá také v přípravě vzorku, kde je kladen důraz na současné trendy umožňující usnadnění, miniaturizaci, redukci času a náročnosti zpracování. Publikovala téměř 180 vědeckých článků s více než 6900 citacemi a je široce zapojena do pedagogických a vzdělávacích aktivit, jako jsou školení HPLC a SFC, semináře a konference.

Juliane Hollender vede výzkumnou skupinu "Procesy osudu kontaminantů" ve Švýcarském federálním ústavu vodních věd a technologií (EAWAG) a zároveň je externí profesorkou environmentální chemie na ETH Zürich. Její výzkum se zaměřuje na osud polárních organických kontaminantů v přírodních i technicky ovlivněných vodních prostředích, přičemž jako klíčovou metodiku využívá kapalinovou chromatografii spojenou s vysokorozlišovací hmotnostní spektrometrií (LC-HRMS). Zvláštní pozornost věnuje necílenému screeningu, který umožňuje získat komplexnější obraz o kontaminaci životního prostředí, stejně jako studiu biologických procesů propojujících expozici a účinky. Od roku 2013 je členkou řídicího výboru sítě NORMAN Network a od roku 2023 působí jako přidružená editorka časopisu Environmental Science & Technology. V letech 2019, 2020 a 2021 byla databází Web of Science oceněna jako Highly Cited Researcher.

Eva Cífková působí ve výzkumné skupině doc. Miroslava Lísy na Katedře chemie Přírodovědecké fakulty Univerzity Hradec Králové. Ve své vědecké činnosti se specializuje na metabolomiku a lipidomiku s využitím vysokoúčinné kapalinové chromatografie ve spojení s hmotnostní spektrometrií (LC/MS). Zaměřuje se nejen na samotnou instrumentální analýzu komplexních biologických vzorků, ale také na navazující biostatistické vyhodnocení rozsáhlých klinických studií. Díky tomuto unikátnímu propojení analytické chemie a datové vědy efektivně překlenuje mezeru mezi surovými experimentálními daty a tvorbou robustních, klinicky relevantních poznatků.

David Friedecký je analytickým chemikem a profesorem lékařské chemie a biochemie na Univerzitě Palackého v Olomouci. Má více než 20 let zkušeností v rutinních diagnostických laboratořích. Jeho odborníkem na aplikace kapalinové chromatografie a hmotnostní spektrometrie při analýze malých molekul. Vyvinul nebo se podílel na vývoji mnoha metod FIA-MS a LC-MS, které našly uplatnění v národním screeningu novorozenců, druhé fázi diagnostiky a terapeutického monitorování léků. V současnosti je vedoucím Oddělení klinické biochemie, Fakultní nemocnice Olomouc. Vědecky se jeho tým Clinical Mass Spectrometry Group na Lékařské fakultě Univerzity Palackého v Olomouci zabývá aplikací klinické metabolomiky a lipidomiky při pochopení patobiochemie chorob (především kardiovaskulárních a neurodegenerativních onemocnění, rakoviny či hyperurikemie a dny), nebo ve vývoji pokročilých multikomponentních metod, které nacházejí uplatnění v klinické praxi.

Roman Grabic je docentem na Fakultě rybářství a ochrany vod Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích. Přednáší v kurzech Chemie životního prostředí, Analýza environmentálních rizik a Environmentální analytická chemie. Profesní kariéru zahájil GC/MS analýzou POP v roce 1993 ve Zdravotním ústavu v Ostravě, po 15 letech se pak přes dvouletý pobyt na oddělení Chemie životního prostředí Univerzity Umeå ve Švédsku dostal k LC/MS. Je autorem a spoluautorem 200+ článků, které se zabývají aplikací GC/MS či LC/MS ve výzkumu životního prostředí. V současnosti se nejvíce věnuje osudu a vlivu kontaminantů ve vodním prostředí a identifikaci nových polutantů pomocí efektově zaměřených analýz a LC/HRMS. 

Mgr. Miroslav Polášek, Ph.D.	prof. PharmDr. Lucie Nováková, Ph.D.	prof. Dr. Juliane Hollender
Ing. Eva Cífková, Ph.D.	prof. RNDr. David Friedecký, Ph.D.	doc. Mgr. Roman Grabic, Ph.D.